В соответствии с частью 1 статьи 5 закона «О НДС», налогом облагаются сделки, совершенные на внутренней территории.

Пункт 6 статьи 1 закона «О НДС» устанавливает, что внутренней территорией является Латвийская Республика.

Если произведено приобретение товаров на территории ЕС, местом приобретения товаров является та страна-участница, на территории которой товары находятся в момент, когда завершилась отправка или транспортировка товаров получателю товаров (статья 16 часть 1 закона «О НДС»). 

Если товары отправляют или транспортируют, местом поставки товара (также для поставки на территории ЕС) является место, где товары находятся в момент, когда началась отправка или транспортировка товаров получателю товаров (статья 12 часть 1 закона «О НДС»).

Таким образом, в упомянутой ситуации, как местом приобретения, так и местом поставки товаров является Германия.

НДС к этим сделкам применяется в соответствии с нормативными актами в сфере НДС Германии. В Вашем случае следовало бы обратиться в налоговую администрацию Германии, выяснить необходимость регистрации плательщиком НДС в данной стране-участнице.  

Упомянутые сделки в декларации НДС Латвии не указываются.